Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCM2LQ9NUG4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCM2LQ9NUG4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms