Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHST12Q9NRB3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms