Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ASCL3Q9NQ33 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms