Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2B-201ENST00000370500 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZRSR1-201ENST00000391338 1673 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 INSL6-201ENST00000381641 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGO1-210ENST00000443724 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPSR1-208ENST00000465305 814 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106868.1-201ENST00000505272 992 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022441.1-201ENST00000512599 794 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms