Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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