Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms