Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIFA3Q9BQP9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms