Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGIP1Q9BQI5 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms