Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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