Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELL2Q99435 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms