Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms