Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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