Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms