Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms