Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC9Q92623 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTC9Q92623 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TTC9Q92623 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TTC9Q92623 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC9Q92623 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TTC9Q92623 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TTC9Q92623 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TTC9Q92623 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC9Q92623 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC9Q92623 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC9Q92623 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC9Q92623 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC9Q92623 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms