Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CNOT9Q92600 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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