Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCSTNQ92542 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms