Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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SEMA6DQ8NFY4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SEMA6DQ8NFY4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA6DQ8NFY4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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