Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIPK4Q8NE63 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms