Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF439Q8NDP4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms