Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RNF148Q8N7C7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF148Q8N7C7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms