Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLIP4Q8N3C7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLIP4Q8N3C7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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