Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms