Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC186Q7Z3E2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms