Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM72Q6ZMU5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms