Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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