Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms