Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms