Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms