Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PDZK1Q5T2W1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PDZK1Q5T2W1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PDZK1Q5T2W1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PDZK1Q5T2W1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PDZK1Q5T2W1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PDZK1Q5T2W1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDZK1Q5T2W1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDZK1Q5T2W1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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