Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms