Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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