Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms