Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MICAQ29983 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MICAQ29983 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MICAQ29983 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MICAQ29983 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms