Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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