Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM187BQ17R55 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FAM187BQ17R55 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FAM187BQ17R55 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FAM187BQ17R55 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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FAM187BQ17R55 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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FAM187BQ17R55 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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