Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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