Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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