Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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