Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PDK4Q16654 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PDK4Q16654 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PDK4Q16654 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PDK4Q16654 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PDK4Q16654 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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