Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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FXNQ16595 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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FXNQ16595 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FXNQ16595 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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FXNQ16595 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FXNQ16595 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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