Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms