Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSRP2Q16527 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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