Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK5Q16478 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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