Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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EXT1Q16394 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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EXT1Q16394 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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EXT1Q16394 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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EXT1Q16394 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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EXT1Q16394 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
EXT1Q16394 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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EXT1Q16394 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXT1Q16394 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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