Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms