Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF4Q15306 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms