Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms