Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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