Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCLAFQ15004 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCLAFQ15004 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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